Le projet de
Ratatouille est au départ de Jan Pikawa, le réalisateur du court-métrage
Le Joueur d’échecs. Le scénario, les décors et les personnages sont le fruit de son imagination qu’il développa pendant trois ans. Cependant, le résultat donna une multiplication d’intrigues floues et un trop grand nombre de personnages principaux. Ce fut
Brad Bird, le réalisateur de
Les Indestructibles, qui reprit le projet et apporta les modifications nécessaires. Il prit donc totalement les commandes du film et, en dix-huit mois, en changea complètement la structure, jusqu'à aboutir à la version finale. Il développa particulièrement la relation entre
Rémy et
Linguini, et donna plus d’importance au personnage de
Colette. En revanche, le titre
Ratatouille choisi par Pikawa lui convint à merveille puisqu’il possède des sonorités très françaises tout en conservant le mot "rat".
Les pixariens ont insisté sur la beauté des rats et le réalisme de leurs poils, qui contrastent avec les personnages humains qui ont des têtes disproportionnées par rapport à leurs corps-élastique.
Les décors sont également très soignés, le film se déroulant à Paris où l’ambiance historico-romantique est mise en avant avec des vues de la Tour Eiffel et des bords de Seine illuminés.
Pour s’inspirer de l’ambiance parisienne, les pixariens se sont rendus une semaine dans la capitale française pour s’imprégner des monuments historiques et des restaurants chics, et à leur retour aux Etats-Unis, ont installé dans leur studio une immense cage remplie de rats. Ainsi ils prirent le temps d’étudier la façon de courir, de marcher ou de dormir des rongeurs.